滋賀県大津にある石山寺の中興の祖、淳祐（しゅんにゅう・890―953年）による巻物です。淳祐は平安時代中期の真言宗の僧であり、祖父は学問の神様と呼ばれているあの菅原道真です。淳祐は般若寺の観賢（かんけん）に師事し、出家。延喜21年（921年）11月、観賢と共に高野山奥の院の御廟にて、入定中の弘法大師の膝に触れたことにより、弘法大師お衣の薫りが淳祐の手に移り、終生消えることがなかったといわれています。そのため、淳祐の書き写した経巻などは弘法大師の薫りが移ったとされ「薫の聖教（かおりのしょうぎょう）」とも呼ばれています。

この金剛頂経には、淳祐以降のこの写経が伝授された人々の名前（淳祐、朗澄、勝賢、覚厳、親祐等の相伝関係）や、承安4年（1174年）の伝授奥書も記されています。また無爲信寺に所蔵されている淳祐の自筆写経は、香樹院釋徳龍（こうじゅいんしゃくとくりゅう・1773―1858年）により、江戸時代後期に集められたものといわれています。

淳祐が書いた写経（自筆写経）は、滋賀県の石山寺の聖教60巻と、京都の仁和寺、醍醐寺に1巻ずつ、そして無爲信寺にあるだけで、とても貴重なものとされています。

縦27cm、長さ10.61mの巻物。紙数24紙からなります。南北朝時代（14世紀前半）に書かれたもので、藤原氏の先祖から鎌倉時代の末までを記しています。

題名はなく、巻末に欠失がありますが、南北朝時代に書き写された藤原氏系図であって、全巻一筆。 日本神話に登場する神、「天児屋根命（あまのこやねのみこと）」から始まる「藤原氏本宗系図」を、道隆、伊周（これちか）までかかげ、ついで道隆の子、隆家を中祖とする「藤原氏庶流系図」を鎌倉時代末まで続けてあります。

内容的には日本の初期の系図集である「尊卑分脈（そんぴぶんみゃく）」所収の摂家相続系図と一致しており、これに「隆家流系図」を接続し、「藤原氏庶流系」として1巻にまとめたものと考えられています。そのため両系図の接続部分において系線に自然さを欠く部分もありますが、書写の様子からみて本巻は草稿段階のものと推定されています。

藤原氏系図の中でも時代のさかのぼる古写本として、大変貴重なものです。